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近緣物種間的基因流既能促進遺傳多樣性，也可能導致基因組同質化。杜鵑花屬是北半球物種最豐富的木本屬，其喜馬拉雅—橫斷山分布中心的物種在頻繁雜交背景下如何維持物種界限，機制尚不明確。近日，中國科學院昆明植物研究所聯合國內外團隊，以該地區糙葉杜鵑亞組的8種杜鵑花為研究對象，通過整合三維基因組（Hi-C）與群體基因組分析，開展杜鵑花屬物種形成過程中基因漸滲的基因組景觀特征研究。研究發現，染色體三維空間結構中的A區室與B區室在基因組分化程度上存在顯著差異。其中，與著絲粒緊密相關的B區室通常表現出較高的遺傳分化。而富含基因的A區室分化程度較低，并呈現更極端的??dm值，表明局部基因漸滲更為廣泛。這種基因組異質性景觀的形成可能源于基因組結構對重組率、突變率和選擇壓力等因素的綜合影響：A區室基因豐富、重組率高，使有益等位基因更易滲入并通過適應性選擇快速固定；而B區室內的著絲粒演化迅速，低重組率加上轉座元件的積累和雜合不相容性等都會抑制B區室的基因流。研究推測，間歇性的基因流結合著絲粒的快速演化，可能是驅動杜鵑花屬物種輻射演化的內部動力之一。A區室的遺傳多樣性與環境異質性則有助于物種對環境變化的快速適應；而B區室緊密關聯著絲粒，為物種分化提供了多樣的進化方向。該研究將三維基因組結構與群體基因組學結合，為理解植物物種形成機制提供了新視角。相關研究成果以The?genomic architecture?of introgression during?Rhododendron?speciation為題，發表在《新植物學家》（New Phytologist）上。研究工作得到國家自然科學基金、國家重點研發計劃和云南省基礎研究專項重大項目的支持。論文鏈接10kb的基因組滑窗下，A/B區室間物種的遺傳分化值及遺傳分異值的差異10kb的基因組滑窗下，A/B區室間物種的基因流分布差異